学校设有暨南大学国际学院、暨南大学文学院、暨南大学外国语学院、暨南大学新闻与传播学院、暨南大学艺术学院、暨南大学经济学院、暨南大学管理学院、暨南大学创业学院、暨南大学公共管理学院/应急管理学院、暨南大学法学院/知识产权学院、暨南大学国际关系学院/华侨华人研究院、暨南大学理工学院、暨南大学信息科学技术学院、暨南大学生命科学技术学院、暨南大学医学院、暨南大学第一临床医学院、暨南大学第二临床医学院、暨南大学药学院、暨南大学华文学院、暨南大学人文学院、暨南大学翻译学院、暨南大学国际商学院、暨南大学电气信息学院、暨南大学深圳旅游学院、暨南大学教育学院、暨南大学环境学院、暨南大学租赁学院等27个学院、59个系，以及体育部、暨南大学四海书院 。

      附属医院：

      截至2014年12月，学校设有18所附属医院，分别是：附属第一医院、附属深圳医院、附属珠海医院、附属广州市红十字会医院、附属清远医院、附属江门中医院、附属深圳眼科医院、附属深圳华侨城医院、附属黄埔中医院、附属惠州口腔医院、附属深圳华侨医院、附属顺德妇儿医院、附属东莞医院、附属暨华医院、附属复大肿瘤医院、附属三九脑科医院、暨南大学郑州医院、附属深圳宝安区妇幼保健院。18家医院共有职工17023人，病床14290张。